Quartus II のテキスト・エディタに直接日本語記入することは出来ません。
簡単な設定を変更することで、汎用のテキストからコピー & ペーストにより日本語表示は可能です。
設定方法を下記に説明させていただきます。

設定方法

1. Quartus II メイン・メニューのツールバーより Tools ⇒ Options ⇒ Text Editor ⇒ Fonts を選択
2. Font 欄から任意に日本語のフォントを選択（MS 明朝 など）
3. 汎用テキストで日本語を入力したものをコピーし、コメント文に貼り付ける

但し、Quartus II は日本語入力をサポートしていないので、上記の設定方法から記入可能ですが、基本的には英数字とアンダーバーでのコメント文作成を推奨いたします。