LDAP、またはIDアクセス管理システムを使用してユーザ認証することはできますか?

はい、可能です。GitHub Enterpriseは、LDAP、CAS、OAuth、SAMLを介して、外部のユーザ認証をサポートしています。セットアッププロセスは、企業のID管理情報を設定するための手順に含まれています。

デフォルトでは、GitHub EnterpriseはGitHub Enterpriseのデータベースに保存されているユーザ情報と“self-contained authentication mode”で稼働します。