GitHub Enterpriseを利用して、子会社A、委託会社Bと共同開発することを検討しております。閲覧権限を分けることは可能でしょうか

リポジトリ毎に閲覧権限を分けることが可能です。自社・A社・B社で閲覧可能なリポジトリ、自社・Aのみで共有するリポジトリ等、設定可能です。