COMポートをオープン或いはクローズする際に、CP210xのTX / RX FIFOをリセットする機能です。

USB Host（PCなど）から受けとったデータをUART側から送信し終える前に COMポートがクローズされ場合や、UART側から受け取ったデータをUSB Hostへ送信し終える前に COMポートがクローズされた場合に、未処理のデータがFIFOにゴミとして残ることになります。その状態のままCOMを再オープンすると、ゴミデータが送信され、アプリケーション的に問題となる場合があります。
Flush Bufferの機能を使うとFIFOをリセットすることができますので、ゴミデータが送信されなくなります。

下図は、Simplicity Studio （デバイスはCP2102N）での設定画面です。