詳細な手順がSiliconLabsのコミュニティサイトにありますので、こちらを参照ください。

大まかな流れとしては、PreferenceのSDKで使用するSDKを選び直す → BLE GATT Configuratorのプロジェクトファイルを微修正する → BLE GATT Configuratorでコードを生成する、となります。