可能です。
"MSC_WRITECMD"レジスタ内にある"ERASEABORT"ビットをセット（0→1に書換え）することで、フラッシュメモリの消去工程を強制的に中断することができます。

また、IRQ割込みが発生したらフラッシュメモリの消去を中断するように、事前に設定しておくことも可能です。この場合は、"MSC_WRITECTRL"レジスタ内にある"IRQERASEABORT"ビットをセット（0→1に書換え）することで実現します。

なお、フラッシュメモリ消去工程が中断されたかどうかは、"MSC_STATUS"レジスタ内にある"ERASEABORTED"ビットで確認が可能です。