PCアプリの設計の仕方によって改善する可能性があります。
SiliconLabsのコミュニティサイトにCP210xの通信の仕組みについての情報がありますが、64byte単位でデータ送信を行うような設計になっています。ですから、データはまとめて送信するのが効率的です。
PCアプリを設計する際に、1byte送信して、1byte送信して…を繰り返すようなソフト設計をしてしまいますと、通信時間は大きく膨らみます。まとめて送信するようにソフト設計を変更すれば、データの転送速度が改善する可能性があります。