MCUにプログラミングする場合、通常はデバッグインタフェース（SW）経由で行いますが、UARTブートローダを使うとUART経由でのプログラミングが可能です。
USBが内蔵されていないEFM32は、フラッシュメモリの先頭にUARTブートローダがプログラミングされた状態で出荷されます。このUARTブートローダは、UART経由で受け取ったデータを、フラッシュメモリに書き込むような作りになっています。つまり、PCからUART経由でプログラミングが行えることになります。

通常は、ユーザコードはフラッシュメモリの先頭（0x0000番地）に配置しますが、ここにブートローダがありますので、Build時にリンカオプションでユーザコードの配置場所にオフセットを指定しなければなりません。詳しい手順はAN0003（UART Bootloader）をご参照ください。
なお、フラッシュメモリにブートローダが配置されていますので、ユーザコードを配置できるサイズがその分小さくなっています。UARTブートローダが不要でしたら、上書き、あるいは消去してください。

なお、EFM32 Gemstone（EFM32PG、EFM32JG）の場合は、ブートローダはユーザコード領域ではなく、専用の領域に配置されています。そのためユーザコードのスペースを消費しないようになっています。

2016/4/14：EFM32PG/JGを追記しました