Stratix V GX のトランシーバ・チャネルや REFCLK ピンを使用する場合には、RREF ピンに1.8KΩ±1% の抵抗を接続してください。

詳細につきましては、下記 URL リンクの Stratix V E、GS and GX ピン・コネクション・ガイドライン、P11をご参照ください
  https://www.altera.com/en_US/pdfs/literature/dp/stratix-v/pcg-01011.pdf

※ RREF ピンに接続する抵抗値につきましては、エラッタ・シートがリリースされておりますので、併せてご参照ください。
  https://www.altera.com/en_US/pdfs/literature/es/es_stratixv.pdf