アルテラ社の PCI Core は PCI のマルチ・ファンクション (Multi-Function) 機能に対応しておりますか?
PCI Express
PCI Core はマルチ・ファンクション機能をサポートしておりません。
Configuration Register の Header Type で、bit 7でマルチ・ファンクション機能をサポート/未サポートが判断できます。
ユーザー・ガイドには "0" と記載されておりますので、未サポートとなります。
この事は、下記 URL リンクのユーザー・ガイドの Header Type より確認できます。
キーワード "Header Type Register" で検索していただき、ご参照ください。
https://www.intel.com/content/dam/www/programmable/us/en/pdfs/literature/ug/ug_pci.pdf
マルチ・ファンクションの場合には他社の PCI Core をご使用ください。