Native エンドポイントは、I/O スペース BAR、32ビットプリフェッチャブルメモリに対応していませんが、新規に PCI-Express のエンドポイントを検討する場合には Native を選択してください。

Legacy エンドポイントは、上記2つが必要な古いシステムとの互換性を保つ場合にのみ選択してください。