Configuration シーケンスの開始から完了までの最大時間は、計算により見積もる事は可能です。
Quartus II 上では見積もることはできません。

Configuration 時間は、Configuration 方法、Configuration データ容量、FPGA 個数、設定などによって異なります。

計算方法の詳細につきましては、各デバイスの Device Handbook より、キーワード "Configuration Time" で検索し、ご確認ください。