MAX 10 FPGAの初期のESデバイスはウォッチドッグタイマーがイネーブルされて出荷されています。このウォッチドッグタイマーはMAX 10のデュアルコンフィギュレーション回路の機能で、安全なフィールドアップデートを可能にするものです。
しかしこの場合間違ってイネーブルされていることでMAX 10 FPGA内のコンフィギュレーションSRAM消去してしまいます。

これを解決するには、不揮発性のFPGAイメージを含むPersonalityをロードしてください。（例えば工場出荷時に書かれている"Dual Config FPGA LOAD"など）
別の方法としてUSB Blasterかコンソールメニューを使用してMAX 10のFlashを消去する方法があります。

詳細はユーザーガイドか、FPGAを消去する方法について書かれた他のFAQを参照ください。